在化工產業鏈中，上游原料來自石油、煤炭、天然氣等能源產品，一旦煤價、油價上漲，將會推動氮肥成本上升，尤其是62%以煤為原料的煤頭企業，這時，以天然氣為原料的企業優勢更加明顯。
按照計算，2008年，以石油、煤炭、天然氣為原料的化肥企業平均生產成本分別約為1300元/噸、1200元/噸和1000元/噸。如果規模更加大，以天然氣為原料的生產企業，其成本可以控制在850元/噸左右。
2007年，氮肥價格曾經深幅下跌，由于生產成本持續上升，一些企業的氮肥價格幾乎降到最低出廠價1400元/噸以下，全行業面臨虧損。但自從2007年第四季度出口關稅由30%降為15%，氮肥出廠零售價由2007年9月中旬的1600元/噸在幾個月內急劇上升了200～300元/噸，漲勢猛烈，全行業迅速走出低谷。
由于全球氮肥需求量不斷增加，2008年以來，國際化肥供不應求，國際價格大幅上漲。截至8月份，國內外尿素差價較大，國外價格大約為800美元/噸，而國內只有2000多元人民幣/噸，有較強的出口競爭力。為抑制化肥產品出口過快增長，滿足國內市場需求，我國2008年以來曾多次調整化肥類商品出口關稅。先是在4月20日至9月30日的用肥旺季內，所有化肥及部分化肥原料加征100%的特別出口關稅。受此影響，第二季度氮肥出口環比大幅下降；之后，從9月1日起至年底，氮肥及合成氨的特別出口關稅又上調150%，其他化肥及化肥原料四季度繼續征收100%特別出口關稅。
以尿素為主的氮肥出口關稅的提高，實際上體現了國家一箭三雕的宏觀調控藝術。首先，氮肥的原料是煤炭，而氮肥基本上不算附加值很高的工業產品，出口氮肥，就相當于出口煤炭這種基本礦產資源，所以，在轉變經濟增長方式的今天，國家還是希望更多地出口高附加值產品。其次，尿素價格上漲，受害最深的是使用化肥的廣大基層農民，抑制化肥出口，就等于大大增加了化肥的國內供應量，化肥價格自然下落，受到實惠的是農民。第三，如果在某些短時期內，化肥的國內外價格存在很高的價差，生產廠商為了謀取更大的商業利潤，還是希望進行一定數量的出口，國家稅收也可比加稅前增加。
事實上，增加出口關稅的效果在今年的10月份就初步顯現了。10月份，氮肥均價較上月大幅下降10.28%至1920元/噸。目前由于國內市場用肥將陸續結束，傳統淡季來臨，市場將繼續在低迷中度過，成交清淡。目前1700~1800元/噸的水平很難回升(見附圖)。與此同時，由于考慮到煤炭價格成本的支撐，這輪化肥的價格跌幅可能會相應收窄，但是低迷的行情將持續，價格也有繼續下跌的可能。但是，也有觀點認為經過2007年以來煤炭、電力、蒸汽等價格的上漲，國內每噸氮肥的成本已經高達1800~1900元/噸，因此即使出口受挫，國內價格下跌，跌幅空間也有限。
