新型肥料在提高肥料利用率、改善土壤結構、提高農產品品質方面具有諸多優點。中國新型肥料在產品創制和品牌創新、服務“接地氣”方面實現了快速發展。參加高峰論壇的專家預測，到2015年中國新型肥料產值有望突破900億，新型肥料已成為中國農業可持續發展的生力軍。
肥料登記證與標簽管理較為嚴格，新型肥料登記具有來源多樣、工藝新型的特點，但由于從制作工藝、產品原料等方面都與單質肥、復合肥等有較大不同，我國尚未對每一個細分品類建立國家標準。但是出于使用科學性及風險考慮，目前農業部規定對五類產品不予進行登記，分別為：
1、原料組成可能存在潛在使用風險，或尚需對其使用效果進行探究的產品。
2、將普通肥料產品經過簡單工藝混配加工制成的，產品性能沒有明顯的提升，且技術指標不穩定的產品。
3、有機水溶肥料沒有完備的有機廢棄物降解生產設備和條件，僅將原料經過簡單工藝混配加工制成的產品。例如申請微量元素水溶肥料造粒的登記產品，主要用于摻混肥料原料。從肥料使用的科學性、安全性考慮，造粒微量元素水溶肥料不予登記。
4、沒有成熟的標準方法，或所提交的檢驗方法無法用于產品質量檢驗合格判定的產品。
5、硒不作為肥料登記證標注的技術指標。
此外，從安全角度考慮，對申請進口的其它有機降解物為原料的產品，應科學評價其生產原料和工藝技術，限制對技術特點不清、養分含量低的產品登記。
