2006年4月至2014年2月，鐵路貨運價格先后上調8次，上調幅度一次比一次大。每一次鐵路貨運價格上漲都會推高
化肥企業物流成本，給化肥企業造成較大的經營困難。
今年2月15日，鐵路貨運價格再次上調，平均上漲1.5分/噸千米。此次上漲主要是針對磷礦石、化肥及金屬礦等物資品種。化肥運價率每噸千米由 0.0976元調整為0.113元，上漲了1.54分/噸千米，漲幅為15.78%，高出貨運平均上調幅度。當前，春耕生產已漸次展開，化肥產、運、銷都進入旺季。在這個節骨眼上鐵路貨運價格上漲，對化肥企業的沖擊影響馬上就顯現出來。
以云天化國際公司為例，公司所屬的云南三環、云峰、紅磷3家主要化肥生產企業物流成本平均漲幅達到18.7%，2014年僅產品物流費用就要增加 9000余萬元。此外，全年通過鐵路運輸到3家分公司的硫黃每噸運費較去年上漲近12元，合計增加物流成本900余萬元，再加上磷礦石等其他大宗原料的物流上漲費用，全年大宗原料鐵路運費將上升約2400萬元。也就是說，產品物流加上原料物流，全年僅這3家分公司就要增加約1.15億元的物流成本。如果再加上三環中化、天安化工、青海云天化國際等省內外關聯企業，云天化國際公司在此次鐵路運費上漲后每年物流成本要增加近4億元。
要減輕鐵路貨運價格上漲帶來的巨大物流成本壓力，無非幾個方法。
第一個方法是化肥產品漲價，把成本壓力轉移給終端消費者。但是這個方法是不可行的，一方面國內化肥產能嚴重過剩，市場競爭激烈。另一方面把成本上漲壓力轉嫁給農民本身也不是一個國企的作為。
第二個方法就是加強內部挖潛，降低制造成本。云天化國際公司通過多年的內部挖潛，各項主要消耗指標已經做到行業領先，加上今年以來硫黃和磷礦石等大宗原料價格有所上漲，所以通過降低消耗、內部挖潛的方法來彌補物流成本上升的空間和潛力都不大，盡管如此，還是要努力繼續挖掘潛力。
第三個方法，可能也是最有效的方法，就是加快轉方式、調結構的步伐，尤其是加快推進產品結構調整，自主研發新型高效、低成本、低消耗、高附加值、市場前景好的磷復肥產品。
客觀地說，鐵路總公司也不容易，多年以來為支持“三農”發展作出了很大的利益犧牲，適度增加運費也是市場規律使然。為共同努力使農民用上更便宜的化肥，保障農民種糧積極性，不僅市場競爭主體要加快調轉和創新，也需要國家給予必要的經濟補償手段，不管這種補償是直接給農民，還是給鐵路總公司、化肥生產商或者流通商。
