使用化肥的莊稼對江河湖海產生的面源污染目前在國內已十分嚴重，而政府部門也正在積極推進有機肥替代化肥的行動，但收效甚微。這除了農民需要認知時間外，還有與國家扶持有機肥產業發展的政策缺失有關。
江蘇省是國內有機肥推行較為不錯的地區，即使每年在省政府補貼農戶每噸150元的情況下，全省一年也只有40萬噸的有機肥的使用量，相比與化肥數百萬噸的年使用量，有機肥還只是杯水車薪。江蘇省為了治理太湖流域面源污染問題，省政府還采用了對有機肥進行統一招標，但普及難度依然很大。
南京土壤肥料協會會長梁曉輝認為，造成當前有機肥普及難的原因是：
一是有機肥不能像其他大宗化肥品種那樣享受鐵路優惠運價。目前，有機肥料業為微利行業，盈利空間很小，如果改由公路運輸，運輸半徑較小。
二是有機肥生產成本高，電價沒有享受優惠政策。
三是長期以來，優質農產品往往賣不出優價出來，嚴重影響了農民使用商品有機肥生產優質農產品的積極性。
四是新建有機肥加工企業難度很大。由于近郊的開發，有些靠近城郊的有機肥企業需要搬遷，可是很多地方租地又不能蓋生產廠房，蓋廠房需要到開發區去買地，而開發區的土地很貴，投資強度要求又高，還要求每畝完成較高的稅收指標，它們不歡迎有機肥企業進入。但如果在養殖密集的區域沒有處理畜禽糞便等有機廢棄物的有機肥廠，那么還會導致畜禽糞便污染環境的惡性循環。
梁曉輝呼吁，政府部門應盡快出臺相關的產業扶持政策，以便該產業能健康良性的發展。（南焱）
